Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C9orf135Q5VTT2 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C9orf135Q5VTT2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms