Protein–RNA interactions for Protein: Q5TF21

SOGA3, Protein SOGA3, humanhuman

Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOGA3Q5TF21 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SOGA3Q5TF21 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SOGA3Q5TF21 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms