Protein–RNA interactions for Protein: Q5T700

LDLRAD1, Low-density lipoprotein receptor class A domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAD1Q5T700 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
LDLRAD1Q5T700 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
LDLRAD1Q5T700 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.8 ms