Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TWISTNBQ3B726 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms