Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CLPPQ16740 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CLPPQ16740 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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