Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SYPL1Q16563 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SYPL1Q16563 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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