Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNHIT3Q15649 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNHIT3Q15649 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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