Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TTF1Q15361 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TTF1Q15361 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
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