Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SSPNQ14714 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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