Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APOFQ13790 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOFQ13790 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOFQ13790 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOFQ13790 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOFQ13790 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOFQ13790 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOFQ13790 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOFQ13790 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
APOFQ13790 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
APOFQ13790 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
APOFQ13790 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
APOFQ13790 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
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