Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
BFSP2Q13515 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BFSP2Q13515 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms