Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TUBB3Q13509 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TUBB3Q13509 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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