Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SRSF6Q13247 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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