Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

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Length 1,484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC31.52■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC31.51■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.64
GRIN2BQ13224 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC31.51■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
GRIN2BQ13224 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.62
GRIN2BQ13224 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC31.45■■■□□ 2.62
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