Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
GRIK3Q13003 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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GRIK3Q13003 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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GRIK3Q13003 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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GRIK3Q13003 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
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GRIK3Q13003 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GRIK3Q13003 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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