Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CD47Q08722 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CD47Q08722 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CD47Q08722 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD47Q08722 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD47Q08722 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD47Q08722 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD47Q08722 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD47Q08722 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD47Q08722 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CD47Q08722 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CD47Q08722 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
CD47Q08722 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms