Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
LTBQ06643 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBQ06643 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBQ06643 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBQ06643 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBQ06643 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
LTBQ06643 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LTBQ06643 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LTBQ06643 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms