Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PSME1Q06323 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PSME1Q06323 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms