Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC090519.2-201ENST00000559034 655 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
TNP2Q05952 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 IFNA1-201ENST00000276927 863 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TMEM14EP-202ENST00000639378 1296 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 LINC01014-203ENST00000455307 548 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ITGB5-AS1-201ENST00000495917 460 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
TNP2Q05952 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms