Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
IRF8Q02556 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms