Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CENPEQ02224 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CENPEQ02224 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms