Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
E2F1Q01094 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
E2F1Q01094 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms