Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ERVK-21P61565 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ERVK-21P61565 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms