Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NME5P56597 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NME5P56597 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NME5P56597 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME5P56597 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME5P56597 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME5P56597 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME5P56597 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME5P56597 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME5P56597 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NME5P56597 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NME5P56597 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms