Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP98P52948 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP98P52948 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP98P52948 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP98P52948 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP98P52948 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NUP98P52948 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NUP98P52948 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP98P52948 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP98P52948 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP98P52948 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP98P52948 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP98P52948 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP98P52948 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP98P52948 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP98P52948 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP98P52948 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP98P52948 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP98P52948 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP98P52948 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP98P52948 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP98P52948 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP98P52948 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP98P52948 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP98P52948 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms