Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
GCLMP48507 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCLMP48507 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCLMP48507 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCLMP48507 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCLMP48507 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCLMP48507 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCLMP48507 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
GCLMP48507 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCLMP48507 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCLMP48507 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCLMP48507 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
GCLMP48507 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GCLMP48507 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GCLMP48507 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
GCLMP48507 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GCLMP48507 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms