Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
MTHFRP42898 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms