Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FLT4P35916 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FLT4P35916 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FLT4P35916 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FLT4P35916 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
FLT4P35916 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FLT4P35916 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FLT4P35916 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FLT4P35916 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FLT4P35916 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FLT4P35916 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLT4P35916 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
FLT4P35916 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLT4P35916 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FLT4P35916 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms