Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
CLIP1P30622 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP1P30622 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms