Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
PTPRMP28827 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
PTPRMP28827 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
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