Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PTPRBP23467 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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