Protein–RNA interactions for Protein: P22607

FGFR3, Fibroblast growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGFR3P22607 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
FGFR3P22607 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms