Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SYT1P21579 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SYT1P21579 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SYT1P21579 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYT1P21579 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYT1P21579 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SYT1P21579 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SYT1P21579 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms