Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TRIM21P19474 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms