Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGB4P16144 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ITGB4P16144 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms