Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC130P13994 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms