Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SAA1P0DJI8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms