Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
EGFRP00533 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
EGFRP00533 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EGFRP00533 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGFRP00533 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGFRP00533 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGFRP00533 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGFRP00533 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGFRP00533 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGFRP00533 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EGFRP00533 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGFRP00533 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGFRP00533 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGFRP00533 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EGFRP00533 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGFRP00533 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGFRP00533 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGFRP00533 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGFRP00533 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGFRP00533 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGFRP00533 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGFRP00533 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGFRP00533 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGFRP00533 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGFRP00533 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGFRP00533 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EGFRP00533 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EGFRP00533 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EGFRP00533 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EGFRP00533 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
EGFRP00533 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms