Protein–RNA interactions for Protein: O95243

MBD4, Methyl-CpG-binding domain protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD4O95243 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
MBD4O95243 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
MBD4O95243 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD4O95243 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD4O95243 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD4O95243 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD4O95243 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD4O95243 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD4O95243 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD4O95243 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD4O95243 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD4O95243 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD4O95243 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD4O95243 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD4O95243 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD4O95243 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
MBD4O95243 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MBD4O95243 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
MBD4O95243 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD4O95243 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD4O95243 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD4O95243 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD4O95243 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD4O95243 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD4O95243 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD4O95243 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD4O95243 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD4O95243 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD4O95243 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD4O95243 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD4O95243 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD4O95243 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD4O95243 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
MBD4O95243 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
MBD4O95243 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD4O95243 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD4O95243 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD4O95243 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD4O95243 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD4O95243 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD4O95243 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD4O95243 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD4O95243 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD4O95243 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD4O95243 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
MBD4O95243 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms