Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRPF40AO75400 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PRPF40AO75400 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms