Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PPFIA3O75145 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms