Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PRKAB2O43741 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms