Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3KR12 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3KR12 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
J3KR12 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
J3KR12 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
J3KR12 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
J3KR12 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
J3KR12 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
J3KR12 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
J3KR12 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
J3KR12 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
J3KR12 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms