Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HHLA1C9JL84 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
HHLA1C9JL84 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms