Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERVV-1B6SEH8 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms