Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SRRM5B3KS81 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRRM5B3KS81 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms