Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85CA6NKD9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85CA6NKD9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms