Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
USP17L4A6NCW7 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
USP17L4A6NCW7 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms