Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
E2F8A0AVK6 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms