Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQN7

SLCO4C1, Solute carrier organic anion transporter family member 4C1, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO4C1Q6ZQN7 TNS3-209ENST00000458317 1156 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC068228.1-201ENST00000461723 211 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC105919.1-201ENST00000507203 393 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC010768.4-201ENST00000528183 520 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC022196.1-202ENST00000559570 462 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC127459.3-201ENST00000624328 466 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AL354696.2-201ENST00000619407 1910 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AL021937.3-201ENST00000446543 361 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 LSM3P4-201ENST00000502948 309 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AL606516.1-201ENST00000455438 1861 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 TM4SF20-201ENST00000304568 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SLCO4C1Q6ZQN7 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms